La temporada inaugural 2006-07 comenzó dos meses después de que el país obtuviera reconocimiento internacional, camisetas del liverpool y solo tres de los doce participantes provenían de la máxima categoría serbomontenegrina. Ambas entidades mantuvieron su dominio en la nueva Primera División de Yugoslavia, tienda camisetas futbol donde los equipos del país quedaron integrados a partir de 1993 con la liga montenegrina reconvertida en tercera categoría. El desmembramiento del equipo, unido a la fatídica final del anterior Mundial, atletico de madrid nueva camiseta resultaron en una nueva decepción. En el 2004 una gran decepción nos invade al perder contra el Sant Cugat (2 a 1) un partido decisivo que condena a permanecer un año más en una categoría, la Primera Regional, que no se corresponde con la historia centenaria ni con la efeméride tan cercana.